პეტრის ჭურჭლის გაწმენდაეს საკმაოდ დამღლელი პროცესია, თუმცა ამ პროცესს შეუძლია ექსპერიმენტები უფრო ეფექტური გახადოს. თუ პეტრის ჯამი არ გაიწმინდება, ექსპერიმენტატორს ექსპერიმენტული მონაცემების დამუშავებაზე მეტი დროის დახარჯვა მოუწევს. ხოლო თუ პეტრის ჯამი საფუძვლიანად გაიწმინდება, ექსპერიმენტატორს ექსპერიმენტის უფრო ეფექტურად ჩატარება შეუძლია.
პეტრის ჭურჭლის ხელით გაწმენდა:
როგორც წესი, ის ოთხ ეტაპს გადის: დალბობა, ხეხვა, მწნილის დამუშავება და გაწმენდა.
1. დალბობა: ახალი ან გამოყენებული მინის ჭურჭელი ჯერ წყალში უნდა დაალბოთ, რათა დარბილდეს და გაიხსნას მიმაგრებული ნაწილაკები. ახალი მინის ჭურჭელი გამოყენებამდე უბრალოდ უნდა გაირეცხოს ონკანის წყლით, შემდეგ კი ღამით დაალბოთ 5%-იან მარილმჟავაში; გამოყენებულ მინის ჭურჭელს ხშირად ბევრი ცილა და ზეთი აქვს მიმაგრებული, რომელთა გაშრობის შემდეგ ჩამობანა ადვილი არ არის, ამიტომ გამოყენებისთანავე უნდა ჩაალბოთ სუფთა წყალში გასაწმენდად.
2. გახეხვა: დასველებული მინის ჭურჭელი მოათავსეთ სარეცხ წყალში და რბილი ფუნჯით განმეორებით გახეხეთ. არ დატოვოთ მკვდარი ადგილი და თავიდან აიცილოთ ჭურჭლის ზედაპირის დაზიანება. გაწმენდილი მინის ჭურჭელი გარეცხეთ და გააშრეთ დასამწნილებლად.
3. მწნილის დამზადება: მწნილის დამზადება გულისხმობს ზემოთ აღნიშნული ჭურჭლის დალბობას საწმენდ ხსნარში, რომელიც ასევე ცნობილია როგორც მჟავა ხსნარი, რათა მჟავა ხსნარის ძლიერი დაჟანგვის გზით მოშორდეს ჭურჭლის ზედაპირზე შესაძლო ნარჩენები. მწნილის დამზადება არ უნდა გაგრძელდეს ექვს საათზე ნაკლები, ჩვეულებრივ, მთელი ღამით ან უფრო დიდხანს. ფრთხილად იყავით ჭურჭელთან.
4. გარეცხვა: გახეხვისა და მწნილის შემდეგ ჭურჭელი სრულად უნდა გაირეცხოს წყლით. მწნილის შემდეგ ჭურჭლის სუფთად გარეცხვა პირდაპირ გავლენას ახდენს უჯრედული კულტურის წარმატებაზე ან წარუმატებლობაზე. მწნილის შემდეგ ჭურჭელი ხელით გარეცხეთ და თითოეული ჭურჭელი განმეორებით უნდა „შეავსოთ-დაცალოთ წყლით“ მინიმუმ 15-ჯერ, ბოლოს კი 2-3-ჯერ უნდა დაალბოთ ორმაგად გამოხდილ წყალში, გააშროთ ან გააშროთ და შეფუთოთ შემდგომი გამოყენებისთვის.

XPZ-ის გამოყენებით გაწმენდის მეთოდილაბორატორიული მინის ჭურჭლის სარეცხი მანქანაპეტრის ჯამის გასაწმენდად:
საწმენდი რაოდენობა: ერთ პარტიაში შესაძლებელია 168 პეტრის ჯამის გაწმენდა.
დასუფთავების დრო: 40 წუთი სრულად დასუფთავებისთვის
გაწმენდის პროცესი: 1. გასაწმენდი პეტრის ჯამი მოათავსეთ ბოთლის გამრეცხი მანქანის შესაბამის კალათაში (ახალი ჯამი შეიძლება პირდაპირ ბოთლის სარეცხ მანქანაში მოათავსოთ, ხოლო კულტურული გარემოთი სავსე პეტრის ჯამიდან კულტურული გარემოს რაც შეიძლება დიდი ნაწილი უნდა ჩაასხათ). ერთი ფენის გაწმენდა შესაძლებელია 56 პეტრის ჯამის, ხოლო ერთ ჯერზე - 168 სამშრიანი პეტრის ჯამის.
2. დახურეთ ბოთლების სარეცხი მანქანის კარი, აირჩიეთ წმენდის პროგრამა და მანქანა ავტომატურად დაიწყებს წმენდას. წმენდის პროცესი მოიცავს წინასწარ წმენდას - ტუტეებით ძირითად რეცხვას - მჟავასთან ნეიტრალიზაციას - სუფთა წყლით გავლებას.
3. გაწმენდის შემდეგ, ბოთლის სარეცხი მანქანის კარი ავტომატურად იხსნება, იღებს გაწმენდილ კულტურულ ჭურჭელს და სტერილიზაციისთვის სტერილიზაციის მოწყობილობაზე გადადის.
ბიოლოგიურ ლაბორატორიებში პეტრის ჭურჭლის გაწმენდა ლაბორატორიის მართვის ძალიან მნიშვნელოვანი ნაწილია. ხელით წმენდის ნაცვლად სრულად ავტომატური ბოთლების სარეცხი მანქანის გამოყენება ხელს უწყობს ექსპერიმენტულ მონაცემებზე ჯვარედინი დაბინძურების ზემოქმედების თავიდან აცილებას, ექსპერიმენტული პერსონალის ჯანმრთელობის დაცვას და ექსპერიმენტის ეფექტურობის გაუმჯობესებას.